Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms