Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2FP61218 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms