Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF3P61204 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF3P61204 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF3P61204 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF3P61204 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF3P61204 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF3P61204 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARF3P61204 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARF3P61204 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF3P61204 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF3P61204 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF3P61204 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF3P61204 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF3P61204 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF3P61204 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF3P61204 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF3P61204 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF3P61204 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF3P61204 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF3P61204 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF3P61204 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF3P61204 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF3P61204 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF3P61204 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF3P61204 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF3P61204 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF3P61204 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF3P61204 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF3P61204 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF3P61204 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF3P61204 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF3P61204 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF3P61204 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF3P61204 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF3P61204 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF3P61204 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF3P61204 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF3P61204 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF3P61204 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF3P61204 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF3P61204 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF3P61204 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF3P61204 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF3P61204 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF3P61204 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF3P61204 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms