Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC8A3P57103 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A3P57103 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms