Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ4P56696 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KCNQ4P56696 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ4P56696 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms