Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC4P56524 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms