Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1P56182 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1P56182 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1P56182 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1P56182 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1P56182 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1P56182 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1P56182 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1P56182 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1P56182 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RRP1P56182 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RRP1P56182 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RRP1P56182 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RRP1P56182 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RRP1P56182 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RRP1P56182 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RRP1P56182 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RRP1P56182 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RRP1P56182 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1P56182 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1P56182 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1P56182 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1P56182 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1P56182 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1P56182 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1P56182 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1P56182 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP1P56182 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP1P56182 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP1P56182 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP1P56182 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP1P56182 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1P56182 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1P56182 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1P56182 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1P56182 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1P56182 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1P56182 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1P56182 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1P56182 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1P56182 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1P56182 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRP1P56182 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRP1P56182 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRP1P56182 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RRP1P56182 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RRP1P56182 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RRP1P56182 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RRP1P56182 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP1P56182 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP1P56182 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP1P56182 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP1P56182 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP1P56182 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP1P56182 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP1P56182 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP1P56182 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP1P56182 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1P56182 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1P56182 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1P56182 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1P56182 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1P56182 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1P56182 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1P56182 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1P56182 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1P56182 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1P56182 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1P56182 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1P56182 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1P56182 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1P56182 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1P56182 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1P56182 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1P56182 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1P56182 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1P56182 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1P56182 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1P56182 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1P56182 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1P56182 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1P56182 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1P56182 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1P56182 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1P56182 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1P56182 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1P56182 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms