Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP12AP54707 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms