Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX1P52954 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX1P52954 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX1P52954 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX1P52954 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX1P52954 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX1P52954 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX1P52954 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX1P52954 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX1P52954 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LBX1P52954 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LBX1P52954 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LBX1P52954 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LBX1P52954 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX1P52954 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX1P52954 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX1P52954 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX1P52954 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX1P52954 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX1P52954 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX1P52954 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX1P52954 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX1P52954 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX1P52954 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX1P52954 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX1P52954 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX1P52954 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX1P52954 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX1P52954 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX1P52954 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX1P52954 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX1P52954 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX1P52954 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX1P52954 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX1P52954 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX1P52954 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX1P52954 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX1P52954 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LBX1P52954 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LBX1P52954 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LBX1P52954 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LBX1P52954 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LBX1P52954 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LBX1P52954 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LBX1P52954 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LBX1P52954 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX1P52954 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX1P52954 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX1P52954 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX1P52954 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX1P52954 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX1P52954 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX1P52954 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX1P52954 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX1P52954 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX1P52954 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX1P52954 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX1P52954 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX1P52954 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX1P52954 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX1P52954 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LBX1P52954 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX1P52954 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX1P52954 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX1P52954 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX1P52954 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX1P52954 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX1P52954 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX1P52954 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX1P52954 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX1P52954 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX1P52954 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX1P52954 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms