Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV1P50549 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV1P50549 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV1P50549 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV1P50549 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV1P50549 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV1P50549 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV1P50549 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV1P50549 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV1P50549 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV1P50549 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETV1P50549 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETV1P50549 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETV1P50549 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETV1P50549 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETV1P50549 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETV1P50549 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETV1P50549 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETV1P50549 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETV1P50549 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETV1P50549 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETV1P50549 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETV1P50549 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETV1P50549 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETV1P50549 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETV1P50549 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETV1P50549 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETV1P50549 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETV1P50549 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETV1P50549 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETV1P50549 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETV1P50549 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETV1P50549 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETV1P50549 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETV1P50549 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETV1P50549 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETV1P50549 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETV1P50549 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETV1P50549 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETV1P50549 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETV1P50549 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETV1P50549 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETV1P50549 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ETV1P50549 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms