Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERFP50548 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERFP50548 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERFP50548 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERFP50548 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERFP50548 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERFP50548 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERFP50548 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERFP50548 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERFP50548 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERFP50548 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERFP50548 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERFP50548 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERFP50548 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERFP50548 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERFP50548 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERFP50548 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERFP50548 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERFP50548 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERFP50548 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERFP50548 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERFP50548 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERFP50548 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERFP50548 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERFP50548 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERFP50548 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERFP50548 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERFP50548 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERFP50548 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERFP50548 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERFP50548 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERFP50548 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERFP50548 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERFP50548 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERFP50548 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERFP50548 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERFP50548 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERFP50548 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERFP50548 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERFP50548 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERFP50548 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERFP50548 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERFP50548 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERFP50548 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERFP50548 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERFP50548 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERFP50548 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERFP50548 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERFP50548 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERFP50548 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERFP50548 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERFP50548 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERFP50548 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERFP50548 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERFP50548 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERFP50548 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERFP50548 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERFP50548 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERFP50548 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ERFP50548 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERFP50548 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERFP50548 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERFP50548 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERFP50548 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms