Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX2P50458 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX2P50458 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX2P50458 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX2P50458 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX2P50458 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX2P50458 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX2P50458 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX2P50458 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX2P50458 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX2P50458 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX2P50458 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX2P50458 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX2P50458 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX2P50458 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LHX2P50458 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX2P50458 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX2P50458 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX2P50458 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX2P50458 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX2P50458 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX2P50458 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX2P50458 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX2P50458 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX2P50458 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX2P50458 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX2P50458 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX2P50458 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX2P50458 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX2P50458 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX2P50458 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX2P50458 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX2P50458 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX2P50458 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX2P50458 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX2P50458 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX2P50458 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX2P50458 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX2P50458 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX2P50458 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX2P50458 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX2P50458 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX2P50458 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX2P50458 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX2P50458 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms