Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TNNI2P48788 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms