Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PI4KAP42356 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms