Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPGP40121 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPGP40121 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPGP40121 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPGP40121 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPGP40121 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPGP40121 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPGP40121 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAPGP40121 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAPGP40121 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAPGP40121 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAPGP40121 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAPGP40121 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPGP40121 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPGP40121 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPGP40121 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPGP40121 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPGP40121 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPGP40121 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPGP40121 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPGP40121 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPGP40121 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPGP40121 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAPGP40121 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPGP40121 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPGP40121 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPGP40121 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPGP40121 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPGP40121 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPGP40121 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPGP40121 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPGP40121 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAPGP40121 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAPGP40121 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPGP40121 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPGP40121 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPGP40121 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPGP40121 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPGP40121 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPGP40121 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPGP40121 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPGP40121 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPGP40121 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPGP40121 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPGP40121 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPGP40121 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPGP40121 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPGP40121 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPGP40121 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPGP40121 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPGP40121 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPGP40121 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPGP40121 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPGP40121 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPGP40121 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPGP40121 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPGP40121 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPGP40121 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPGP40121 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPGP40121 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPGP40121 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPGP40121 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPGP40121 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPGP40121 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPGP40121 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPGP40121 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPGP40121 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPGP40121 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPGP40121 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms