Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YPK3YBR028C 1578 nt4.13□□□□□ -1.75
AVT5P38176 ABD1YBR236C 1311 nt4.13□□□□□ -1.75
AVT5P38176 APL6YGR261C 2430 nt4.13□□□□□ -1.75
AVT5P38176 FAP1YNL023C 2898 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 SAC1YKL212W 1872 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 MRPL32YCR003W 552 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 YDR336WYDR336W 945 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 HAT2YEL056W 1206 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 MOB2YFL034C-B 864 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 DAM1YGR113W 1032 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 YGR273CYGR273C 525 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 SPL2YHR136C 447 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 NVJ1YHR195W 966 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 HYM1YKL189W 1200 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 BTS1YPL069C 1008 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 SRB6YBR253W 366 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 COQ6YGR255C 1440 nt4.12□□□□□ -1.75
AVT5P38176 SSB1YDL229W 1842 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 SSB2YNL209W 1842 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 YMR196WYMR196W 3267 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 YCR016WYCR016W 873 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 PCL2YDL127W 927 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 TRM8YDL201W 861 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 NSE3YDR288W 912 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 BCP1YDR361C 852 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 NAG1YGR031C-A 492 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 YGR168CYGR168C 1131 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 TRX2YGR209C 315 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 YHR127WYHR127W 732 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 CBF1YJR060W 1056 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 PRM9YAR031W 897 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 MET16YPR167C 786 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 ZUO1YGR285C 1302 nt4.11□□□□□ -1.75
AVT5P38176 YOL153CYOL153C 1746 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 RMD1YDL001W 1293 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 IWR1YDL115C 1062 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 MRPL7YDR237W 879 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 TDH3YGR192C 999 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 YJL068CYJL068C 900 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 LIP2YLR239C 987 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 CDA2YLR308W 939 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 PSY3YLR376C 729 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 MER1YNL210W 813 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 YNL303WYNL303W 348 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 RER2YBR002C 861 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 RER1YCL001W 567 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 GAL4YPL248C 2646 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 SAP155YFR040W 3009 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 RRN11YML043C 1524 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 SEN1YLR430W 6696 nt4.1□□□□□ -1.75
AVT5P38176 TMN2YDR107C 2019 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 PEP5YMR231W 3090 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 RRP17YDR412W 708 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 YKL023WYKL023W 834 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 POM33YLL023C 840 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 SPO20YMR017W 1194 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 GPI12YMR281W 915 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 TLG2YOL018C 1194 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 YOL166CYOL166C 339 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 TFB6YOR352W 1032 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 POP4YBR257W 840 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 PAN1YIR006C 4443 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 HST1YOL068C 1512 nt4.09□□□□□ -1.75
AVT5P38176 GAS2YLR343W 1668 nt4.09□□□□□ -1.76
AVT5P38176 MKS1YNL076W 1755 nt4.09□□□□□ -1.76
AVT5P38176 GSY1YFR015C 2127 nt4.09□□□□□ -1.76
AVT5P38176 MBP1YDL056W 2502 nt4.09□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YDL026WYDL026W 312 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 KRS1YDR037W 1776 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 EUG1YDR518W 1554 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 ARI1YGL157W 1044 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SYF2YGR129W 648 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 ARG4YHR018C 1392 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 EFM4YIL064W 774 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 THS1YIL078W 2205 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 TIM54YJL054W 1437 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SAW1YAL027W 786 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 MTC2YKL098W 1074 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 ISA1YLL027W 753 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YLR118CYLR118C 684 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YAP1YML007W 1953 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 BDP1YNL039W 1785 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YNL134CYNL134C 1131 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YOL107WYOL107W 1029 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 ANT1YPR128C 987 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 HPC2YBR215W 1878 nt4.08□□□□□ -1.76
AVT5P38176 FRE1YLR214W 2061 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SSA2YLL024C 1920 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 AIM10YER087W 1731 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 ADE4YMR300C 1533 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 MDM34YGL219C 1380 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SCM3YDL139C 672 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YDL172CYDL172C 480 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 PIB1YDR313C 861 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YHR112CYHR112C 1137 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 KTI12YKL110C 942 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YPR015CYPR015C 744 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SLM4YBR077C 489 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 PRM7YDL039C 2097 nt4.07□□□□□ -1.76
AVT5P38176 BUD22YMR014W 1560 nt4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.7 ms