Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFC4P35249 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFC4P35249 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFC4P35249 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFC4P35249 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFC4P35249 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RFC4P35249 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFC4P35249 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RFC4P35249 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RFC4P35249 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RFC4P35249 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFC4P35249 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFC4P35249 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFC4P35249 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFC4P35249 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFC4P35249 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFC4P35249 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFC4P35249 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFC4P35249 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFC4P35249 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFC4P35249 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFC4P35249 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFC4P35249 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFC4P35249 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFC4P35249 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFC4P35249 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFC4P35249 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFC4P35249 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFC4P35249 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFC4P35249 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFC4P35249 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFC4P35249 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFC4P35249 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFC4P35249 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFC4P35249 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFC4P35249 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFC4P35249 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC4P35249 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFC4P35249 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFC4P35249 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFC4P35249 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFC4P35249 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFC4P35249 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFC4P35249 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFC4P35249 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFC4P35249 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFC4P35249 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFC4P35249 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RFC4P35249 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFC4P35249 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFC4P35249 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
RFC4P35249 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFC4P35249 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFC4P35249 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFC4P35249 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFC4P35249 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFC4P35249 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RFC4P35249 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFC4P35249 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC4P35249 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC4P35249 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC4P35249 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC4P35249 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC4P35249 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC4P35249 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC4P35249 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC4P35249 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC4P35249 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC4P35249 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC4P35249 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC4P35249 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC4P35249 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC4P35249 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC4P35249 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC4P35249 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC4P35249 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC4P35249 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC4P35249 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC4P35249 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC4P35249 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC4P35249 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC4P35249 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RFC4P35249 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFC4P35249 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RFC4P35249 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFC4P35249 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms