Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP1P32455 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP1P32455 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP1P32455 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP1P32455 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP1P32455 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP1P32455 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP1P32455 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP1P32455 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP1P32455 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP1P32455 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP1P32455 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP1P32455 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP1P32455 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP1P32455 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP1P32455 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP1P32455 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP1P32455 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP1P32455 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP1P32455 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP1P32455 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP1P32455 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP1P32455 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP1P32455 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP1P32455 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP1P32455 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP1P32455 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP1P32455 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP1P32455 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP1P32455 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP1P32455 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP1P32455 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP1P32455 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP1P32455 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GBP1P32455 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP1P32455 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP1P32455 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP1P32455 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP1P32455 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP1P32455 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP1P32455 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP1P32455 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP1P32455 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP1P32455 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP1P32455 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP1P32455 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP1P32455 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP1P32455 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP1P32455 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP1P32455 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP1P32455 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP1P32455 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP1P32455 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP1P32455 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP1P32455 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP1P32455 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP1P32455 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP1P32455 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP1P32455 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP1P32455 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP1P32455 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP1P32455 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP1P32455 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP1P32455 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP1P32455 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP1P32455 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP1P32455 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP1P32455 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP1P32455 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP1P32455 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP1P32455 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP1P32455 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms