Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM4SF1P30408 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms