Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A5P29400 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms