Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTGFP29279 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CTGFP29279 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTGFP29279 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTGFP29279 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTGFP29279 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTGFP29279 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTGFP29279 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTGFP29279 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTGFP29279 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTGFP29279 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTGFP29279 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTGFP29279 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTGFP29279 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTGFP29279 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTGFP29279 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CTGFP29279 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTGFP29279 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTGFP29279 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTGFP29279 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTGFP29279 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTGFP29279 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTGFP29279 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTGFP29279 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTGFP29279 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTGFP29279 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTGFP29279 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTGFP29279 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTGFP29279 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTGFP29279 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTGFP29279 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTGFP29279 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTGFP29279 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTGFP29279 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTGFP29279 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTGFP29279 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTGFP29279 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTGFP29279 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTGFP29279 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTGFP29279 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTGFP29279 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTGFP29279 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTGFP29279 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTGFP29279 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTGFP29279 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTGFP29279 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTGFP29279 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTGFP29279 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTGFP29279 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTGFP29279 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTGFP29279 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTGFP29279 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTGFP29279 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTGFP29279 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTGFP29279 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTGFP29279 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTGFP29279 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTGFP29279 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTGFP29279 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTGFP29279 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTGFP29279 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTGFP29279 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTGFP29279 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTGFP29279 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTGFP29279 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTGFP29279 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTGFP29279 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTGFP29279 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTGFP29279 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTGFP29279 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTGFP29279 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTGFP29279 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTGFP29279 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTGFP29279 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTGFP29279 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTGFP29279 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTGFP29279 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTGFP29279 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTGFP29279 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTGFP29279 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTGFP29279 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTGFP29279 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTGFP29279 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTGFP29279 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTGFP29279 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTGFP29279 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTGFP29279 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTGFP29279 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms