Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR2AP28223 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms