Protein–RNA interactions for Protein: P27816

MAP4, Microtubule-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4P27816 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4P27816 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4P27816 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4P27816 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4P27816 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAP4P27816 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAP4P27816 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4P27816 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4P27816 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4P27816 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4P27816 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4P27816 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4P27816 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4P27816 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4P27816 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4P27816 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4P27816 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4P27816 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4P27816 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4P27816 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4P27816 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4P27816 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4P27816 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4P27816 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4P27816 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4P27816 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4P27816 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4P27816 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4P27816 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4P27816 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4P27816 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4P27816 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4P27816 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4P27816 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4P27816 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4P27816 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4P27816 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4P27816 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4P27816 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4P27816 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4P27816 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4P27816 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4P27816 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4P27816 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4P27816 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4P27816 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4P27816 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP4P27816 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP4P27816 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP4P27816 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP4P27816 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP4P27816 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP4P27816 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP4P27816 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP4P27816 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP4P27816 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP4P27816 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP4P27816 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP4P27816 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP4P27816 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP4P27816 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP4P27816 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP4P27816 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP4P27816 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP4P27816 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP4P27816 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP4P27816 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP4P27816 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP4P27816 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP4P27816 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms