Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM3P25205 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM3P25205 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM3P25205 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM3P25205 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM3P25205 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM3P25205 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM3P25205 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM3P25205 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM3P25205 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM3P25205 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM3P25205 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM3P25205 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM3P25205 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM3P25205 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM3P25205 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM3P25205 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM3P25205 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM3P25205 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM3P25205 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM3P25205 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM3P25205 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCM3P25205 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCM3P25205 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCM3P25205 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCM3P25205 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCM3P25205 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCM3P25205 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCM3P25205 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCM3P25205 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCM3P25205 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCM3P25205 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM3P25205 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM3P25205 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM3P25205 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM3P25205 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM3P25205 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM3P25205 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM3P25205 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM3P25205 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM3P25205 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM3P25205 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM3P25205 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM3P25205 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM3P25205 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM3P25205 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM3P25205 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM3P25205 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM3P25205 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM3P25205 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM3P25205 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM3P25205 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM3P25205 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM3P25205 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM3P25205 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM3P25205 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM3P25205 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM3P25205 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM3P25205 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM3P25205 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM3P25205 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM3P25205 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM3P25205 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM3P25205 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM3P25205 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM3P25205 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM3P25205 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM3P25205 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM3P25205 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM3P25205 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM3P25205 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms