Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRGP23470 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
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