Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRDP23468 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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