Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD247P20963 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD247P20963 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD247P20963 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD247P20963 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD247P20963 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD247P20963 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD247P20963 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD247P20963 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD247P20963 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD247P20963 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD247P20963 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD247P20963 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD247P20963 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD247P20963 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD247P20963 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD247P20963 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD247P20963 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD247P20963 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD247P20963 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD247P20963 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD247P20963 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CD247P20963 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD247P20963 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD247P20963 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms