Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOT1P17174 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOT1P17174 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOT1P17174 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOT1P17174 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOT1P17174 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOT1P17174 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOT1P17174 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOT1P17174 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOT1P17174 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOT1P17174 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOT1P17174 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOT1P17174 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOT1P17174 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOT1P17174 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOT1P17174 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOT1P17174 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOT1P17174 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOT1P17174 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOT1P17174 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOT1P17174 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOT1P17174 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOT1P17174 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOT1P17174 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOT1P17174 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOT1P17174 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOT1P17174 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GOT1P17174 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOT1P17174 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOT1P17174 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOT1P17174 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOT1P17174 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOT1P17174 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOT1P17174 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOT1P17174 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOT1P17174 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOT1P17174 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOT1P17174 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOT1P17174 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOT1P17174 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOT1P17174 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms