Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF43P17038 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms