Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA1P14867 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA1P14867 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms