Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL5P13501 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL5P13501 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL5P13501 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL5P13501 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL5P13501 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL5P13501 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL5P13501 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL5P13501 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL5P13501 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL5P13501 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL5P13501 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL5P13501 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL5P13501 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL5P13501 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL5P13501 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL5P13501 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL5P13501 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL5P13501 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL5P13501 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL5P13501 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL5P13501 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL5P13501 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL5P13501 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL5P13501 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL5P13501 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL5P13501 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL5P13501 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL5P13501 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL5P13501 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL5P13501 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL5P13501 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL5P13501 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL5P13501 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL5P13501 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL5P13501 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL5P13501 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL5P13501 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL5P13501 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL5P13501 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL5P13501 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL5P13501 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL5P13501 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL5P13501 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL5P13501 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL5P13501 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL5P13501 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL5P13501 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL5P13501 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL5P13501 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL5P13501 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL5P13501 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL5P13501 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL5P13501 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL5P13501 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL5P13501 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL5P13501 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL5P13501 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL5P13501 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL5P13501 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL5P13501 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL5P13501 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL5P13501 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL5P13501 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL5P13501 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL5P13501 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL5P13501 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL5P13501 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL5P13501 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL5P13501 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL5P13501 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL5P13501 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL5P13501 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL5P13501 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL5P13501 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCL5P13501 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCL5P13501 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL5P13501 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL5P13501 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL5P13501 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL5P13501 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL5P13501 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL5P13501 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL5P13501 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL5P13501 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL5P13501 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL5P13501 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL5P13501 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL5P13501 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL5P13501 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL5P13501 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL5P13501 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL5P13501 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL5P13501 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL5P13501 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL5P13501 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL5P13501 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms