Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD8P13378 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms