Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CBSLP0DN79 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms