Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms