Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTAP09496 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTAP09496 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTAP09496 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTAP09496 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTAP09496 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTAP09496 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTAP09496 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTAP09496 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTAP09496 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTAP09496 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTAP09496 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTAP09496 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTAP09496 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTAP09496 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTAP09496 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTAP09496 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTAP09496 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTAP09496 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTAP09496 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTAP09496 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTAP09496 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTAP09496 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTAP09496 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTAP09496 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTAP09496 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTAP09496 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTAP09496 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTAP09496 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTAP09496 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTAP09496 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTAP09496 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTAP09496 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTAP09496 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTAP09496 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTAP09496 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTAP09496 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTAP09496 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTAP09496 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTAP09496 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTAP09496 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTAP09496 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTAP09496 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTAP09496 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTAP09496 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTAP09496 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTAP09496 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTAP09496 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTAP09496 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTAP09496 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTAP09496 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTAP09496 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTAP09496 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTAP09496 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTAP09496 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTAP09496 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTAP09496 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTAP09496 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTAP09496 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTAP09496 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTAP09496 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTAP09496 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTAP09496 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTAP09496 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTAP09496 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTAP09496 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTAP09496 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTAP09496 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTAP09496 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTAP09496 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTAP09496 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTAP09496 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTAP09496 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTAP09496 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTAP09496 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTAP09496 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTAP09496 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTAP09496 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTAP09496 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTAP09496 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTAP09496 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTAP09496 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTAP09496 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms