Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSLP07711 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSLP07711 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSLP07711 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSLP07711 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSLP07711 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSLP07711 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSLP07711 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSLP07711 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSLP07711 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSLP07711 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSLP07711 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSLP07711 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSLP07711 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSLP07711 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSLP07711 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSLP07711 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSLP07711 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSLP07711 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSLP07711 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSLP07711 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSLP07711 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSLP07711 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSLP07711 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSLP07711 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSLP07711 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSLP07711 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSLP07711 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSLP07711 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSLP07711 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSLP07711 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSLP07711 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSLP07711 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSLP07711 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSLP07711 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSLP07711 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSLP07711 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSLP07711 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSLP07711 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSLP07711 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSLP07711 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSLP07711 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSLP07711 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSLP07711 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSLP07711 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSLP07711 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSLP07711 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSLP07711 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSLP07711 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSLP07711 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSLP07711 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSLP07711 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSLP07711 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSLP07711 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSLP07711 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSLP07711 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSLP07711 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSLP07711 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSLP07711 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSLP07711 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSLP07711 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSLP07711 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSLP07711 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSLP07711 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSLP07711 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSLP07711 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSLP07711 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSLP07711 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSLP07711 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms