Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLK3P07288 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLK3P07288 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLK3P07288 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLK3P07288 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLK3P07288 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLK3P07288 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLK3P07288 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLK3P07288 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLK3P07288 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLK3P07288 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLK3P07288 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLK3P07288 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLK3P07288 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLK3P07288 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLK3P07288 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLK3P07288 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLK3P07288 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLK3P07288 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLK3P07288 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLK3P07288 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLK3P07288 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLK3P07288 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLK3P07288 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLK3P07288 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLK3P07288 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLK3P07288 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLK3P07288 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLK3P07288 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLK3P07288 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLK3P07288 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLK3P07288 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLK3P07288 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLK3P07288 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLK3P07288 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLK3P07288 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLK3P07288 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLK3P07288 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLK3P07288 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLK3P07288 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLK3P07288 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLK3P07288 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLK3P07288 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLK3P07288 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLK3P07288 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLK3P07288 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLK3P07288 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLK3P07288 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLK3P07288 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLK3P07288 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLK3P07288 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLK3P07288 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLK3P07288 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLK3P07288 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLK3P07288 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLK3P07288 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLK3P07288 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLK3P07288 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLK3P07288 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLK3P07288 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLK3P07288 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLK3P07288 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLK3P07288 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLK3P07288 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLK3P07288 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLK3P07288 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLK3P07288 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLK3P07288 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLK3P07288 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms