Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMP06732 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMP06732 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMP06732 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMP06732 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMP06732 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMP06732 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMP06732 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMP06732 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMP06732 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMP06732 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMP06732 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMP06732 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMP06732 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMP06732 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMP06732 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CKMP06732 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKMP06732 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKMP06732 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKMP06732 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKMP06732 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMP06732 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMP06732 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMP06732 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMP06732 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMP06732 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMP06732 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMP06732 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMP06732 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMP06732 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMP06732 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMP06732 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMP06732 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMP06732 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMP06732 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMP06732 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMP06732 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMP06732 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMP06732 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMP06732 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMP06732 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMP06732 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMP06732 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMP06732 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMP06732 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMP06732 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMP06732 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMP06732 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMP06732 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMP06732 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMP06732 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMP06732 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMP06732 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMP06732 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMP06732 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMP06732 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMP06732 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMP06732 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMP06732 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMP06732 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMP06732 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMP06732 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMP06732 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMP06732 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKMP06732 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKMP06732 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKMP06732 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMP06732 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMP06732 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMP06732 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMP06732 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMP06732 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMP06732 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMP06732 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMP06732 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMP06732 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CKMP06732 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CKMP06732 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CKMP06732 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMP06732 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKMP06732 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CKMP06732 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKMP06732 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKMP06732 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMP06732 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMP06732 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMP06732 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms