Protein–RNA interactions for Protein: P01116

KRAS, GTPase KRas, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRASP01116 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRASP01116 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRASP01116 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRASP01116 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRASP01116 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRASP01116 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRASP01116 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRASP01116 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRASP01116 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRASP01116 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRASP01116 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRASP01116 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRASP01116 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRASP01116 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRASP01116 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KRASP01116 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRASP01116 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRASP01116 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRASP01116 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRASP01116 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRASP01116 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRASP01116 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRASP01116 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRASP01116 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRASP01116 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRASP01116 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRASP01116 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRASP01116 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KRASP01116 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRASP01116 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRASP01116 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRASP01116 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRASP01116 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRASP01116 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRASP01116 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRASP01116 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRASP01116 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRASP01116 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRASP01116 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRASP01116 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRASP01116 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRASP01116 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRASP01116 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KRASP01116 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRASP01116 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRASP01116 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRASP01116 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRASP01116 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRASP01116 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRASP01116 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRASP01116 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRASP01116 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRASP01116 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRASP01116 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRASP01116 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRASP01116 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRASP01116 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRASP01116 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRASP01116 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRASP01116 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRASP01116 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRASP01116 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRASP01116 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRASP01116 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRASP01116 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRASP01116 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRASP01116 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRASP01116 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRASP01116 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRASP01116 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRASP01116 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRASP01116 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRASP01116 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRASP01116 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRASP01116 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRASP01116 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRASP01116 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRASP01116 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRASP01116 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRASP01116 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRASP01116 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRASP01116 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRASP01116 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRASP01116 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRASP01116 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms