Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F2P00734 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F2P00734 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
F2P00734 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
F2P00734 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F2P00734 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F2P00734 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F2P00734 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F2P00734 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
F2P00734 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F2P00734 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
F2P00734 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F2P00734 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
F2P00734 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F2P00734 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
F2P00734 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
F2P00734 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F2P00734 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
F2P00734 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F2P00734 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F2P00734 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
F2P00734 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F2P00734 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
F2P00734 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F2P00734 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
F2P00734 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F2P00734 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
F2P00734 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
F2P00734 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
F2P00734 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F2P00734 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
F2P00734 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F2P00734 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
F2P00734 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
F2P00734 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
F2P00734 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
F2P00734 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
F2P00734 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
F2P00734 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
F2P00734 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
F2P00734 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P00734 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P00734 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P00734 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P00734 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P00734 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P00734 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P00734 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P00734 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P00734 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P00734 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P00734 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P00734 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P00734 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P00734 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
F2P00734 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P00734 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms