Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD3O95983 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD3O95983 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD3O95983 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD3O95983 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD3O95983 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD3O95983 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD3O95983 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD3O95983 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD3O95983 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD3O95983 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD3O95983 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD3O95983 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD3O95983 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD3O95983 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD3O95983 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD3O95983 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD3O95983 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD3O95983 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD3O95983 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD3O95983 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD3O95983 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD3O95983 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD3O95983 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD3O95983 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD3O95983 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD3O95983 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD3O95983 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD3O95983 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MBD3O95983 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD3O95983 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD3O95983 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD3O95983 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD3O95983 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD3O95983 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD3O95983 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD3O95983 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD3O95983 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD3O95983 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD3O95983 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD3O95983 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD3O95983 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD3O95983 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD3O95983 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD3O95983 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD3O95983 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD3O95983 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD3O95983 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD3O95983 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD3O95983 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD3O95983 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD3O95983 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD3O95983 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD3O95983 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD3O95983 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD3O95983 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD3O95983 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD3O95983 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD3O95983 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD3O95983 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD3O95983 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD3O95983 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD3O95983 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD3O95983 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms