Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX7O95931 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX7O95931 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX7O95931 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX7O95931 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX7O95931 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX7O95931 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX7O95931 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX7O95931 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX7O95931 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX7O95931 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX7O95931 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX7O95931 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX7O95931 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX7O95931 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX7O95931 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX7O95931 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX7O95931 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX7O95931 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX7O95931 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX7O95931 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX7O95931 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX7O95931 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX7O95931 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX7O95931 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX7O95931 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX7O95931 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX7O95931 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX7O95931 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX7O95931 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX7O95931 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX7O95931 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX7O95931 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX7O95931 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX7O95931 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX7O95931 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBX7O95931 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms