Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGDSO95455 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGDSO95455 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGDSO95455 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGDSO95455 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TGDSO95455 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGDSO95455 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGDSO95455 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGDSO95455 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGDSO95455 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGDSO95455 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGDSO95455 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGDSO95455 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGDSO95455 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGDSO95455 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGDSO95455 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGDSO95455 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGDSO95455 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGDSO95455 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGDSO95455 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGDSO95455 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TGDSO95455 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGDSO95455 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGDSO95455 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGDSO95455 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGDSO95455 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGDSO95455 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGDSO95455 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGDSO95455 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGDSO95455 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGDSO95455 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGDSO95455 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGDSO95455 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGDSO95455 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGDSO95455 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGDSO95455 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TGDSO95455 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGDSO95455 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGDSO95455 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGDSO95455 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGDSO95455 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGDSO95455 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGDSO95455 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGDSO95455 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGDSO95455 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGDSO95455 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGDSO95455 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGDSO95455 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGDSO95455 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGDSO95455 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGDSO95455 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGDSO95455 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGDSO95455 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGDSO95455 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TGDSO95455 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TGDSO95455 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms