Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC2O95409 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZIC2O95409 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZIC2O95409 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC2O95409 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC2O95409 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC2O95409 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC2O95409 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC2O95409 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC2O95409 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC2O95409 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC2O95409 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC2O95409 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC2O95409 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC2O95409 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms