Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN1O94985 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms