Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UFL1O94874 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UFL1O94874 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UFL1O94874 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UFL1O94874 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UFL1O94874 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UFL1O94874 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UFL1O94874 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UFL1O94874 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UFL1O94874 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UFL1O94874 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
UFL1O94874 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UFL1O94874 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UFL1O94874 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UFL1O94874 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
UFL1O94874 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UFL1O94874 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UFL1O94874 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UFL1O94874 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UFL1O94874 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UFL1O94874 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UFL1O94874 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UFL1O94874 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UFL1O94874 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UFL1O94874 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UFL1O94874 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UFL1O94874 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UFL1O94874 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UFL1O94874 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UFL1O94874 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UFL1O94874 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UFL1O94874 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UFL1O94874 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UFL1O94874 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
UFL1O94874 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UFL1O94874 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UFL1O94874 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UFL1O94874 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UFL1O94874 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
UFL1O94874 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
UFL1O94874 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UFL1O94874 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UFL1O94874 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms