Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA3O75764 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA3O75764 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms