Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIPRLO75663 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIPRLO75663 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIPRLO75663 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIPRLO75663 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIPRLO75663 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIPRLO75663 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIPRLO75663 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIPRLO75663 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIPRLO75663 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms