Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL41O60662 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms