Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSL4O60488 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms